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Issue
Ann. For. Sci.
Volume 65, Number 7, October-November 2008
Article Number 710
Number of page(s) 13
DOI http://dx.doi.org/10.1051/forest:2008057
Published online 24 October 2008
Ann. For. Sci. 65 (2008) 710
DOI: 10.1051/forest:2008057

Genetic structure of Tunisian natural carob tree (Ceratonia siliqua L.) populations inferred from RAPD markers

Makrem Afif1, Chokri Messaoud1, Abdennacer Boulila1, Hnia Chograni1, Afef Bejaoui1, Mohamed Nejib Rejeb2 and Mohamed Boussaid1

1  National Institute of Applied Sciences and Technology (INSAT) Department of Biology Laboratory of Plant Biotechnology Centre Urbain Nord, BP 676, 1080 Tunis Cedex, Tunisia
2  National Institute of Research in Agricultural Engineering, Water and Forests, BP 10, Ariana- 2080 Tunisia

Received 29 October 2007; accepted 1 July 2008; published online 24 October 2008

Abstract - $\bullet$ Seven RAPD markers were used to assess the genetic diversity and structure of ten Tunisian natural Ceratonia siliqua L. populations from different geographic and bioclimatic zones. $\bullet$ The species maintain a high diversity within population as estimated by the percentage of polymorphic loci and Shannon's index (P% = 76.31, $\overline {\rm H}_{\rm pop}^{'}$ = 0.569). The range of variation between populations was large. Populations from the upper semi-arid bioclimates, with more continuous distribution area showed the highest level of variation. $\bullet$ A high genetic differentiation among populations ( ${\rm\Phi}_{\rm ST}$ = 0.250 and $\overline {\rm G}_{\rm ST}$ = 0.347), as a result of population isolation was revealed. Nevertheless, the genetic structure is in accordance with bioclimate indicating that ecological factors also should influence differentiation. Populations from the sub-humid, upper semi-arid and mean semi-arid zones clustered together and were distinct from those of the lower semi-arid ones. $\bullet$ Conservation strategy should be made according to the level of polymorphism within population and bioclimate.


Résumé - Structure génétique des populations naturelles du caroubier (Ceratonia siliqua L.) en Tunisie estimée par les marqueurs RAPD. $\bullet$ Sept marqueurs RAPD ont été utilisés pour analyser la diversité et la structure génétique de dix populations tunisiennes de caroubier (Ceratonia siliqua L.) prospectées dans différentes zones géographiques et bioclimatiques. $\bullet$ L'espèce maintient une diversité génétique intra population importante ($P{\%}$ = 76.31; $\overline {\rm H}^{'}_{\rm pop}$ = 0.569) et les niveaux de variation diffèrent selon les populations. Celles du subhumide et du semi-aride supérieur, à aire de distribution plus continue, ont montré la variation la plus importante. $\bullet$ Une forte différenciation ( ${\rm\Phi}_{\rm ST}$ = 0.250 et $\overline {\rm G}^{'}_{\rm ST}$ = 0.347) entre les populations, due à leur fragmentation récente, est observée. Toutefois, cette différenciation concorde avec le bioclimat des sites témoignant l'influence des facteurs écologiques dans cette différenciation. Les populations du subhumide, du semi-aride supérieur et du semi-aride moyen constituent un groupe distinct de celui représenté par les populations du semi-aride inférieur. $\bullet$ La conservation des populations doit tenir compte de leur niveau de diversité génétique intra population et du bioclimat.


Key words: genetic diversity / RAPD / Ceratonia siliqua / natural populations / bioclimate / conservation

Mots clés : diversité génétique / RAPD / Ceratonia siliqua / populations naturelles / bioclimat / conservation

Corresponding author: mohamed.boussaid@insat.rnu.tn

© INRA, EDP Sciences 2008