Ann. For. Sci. 59 (2002) 675-678
DOI: 10.1051/forest:2002055

Identification of PCR-based markers linked to wood splitting in Eucalyptus grandis

Eugenia Barros^a, Steve Verryn^b and Marianne Hettasch<sup>b

a</sup>  CSIR-Bio/Chemtek, P.O.Box 395, Pretoria 0001, South Africa
^b  CSIR-Environmentek, P.O.Box 395, Pretoria 0001, South Africa

(Received 5 July 2001; accepted 17 April 2002)

Abstract
Wood splitting is a defect in eucalyptus which results in considerable losses when converting logs to solid wood products. Commonly in forestry, molecular markers are identified through studying pedigrees from a single cross. This limits the application of these markers to that population. Here we report the identification of putative molecular markers linked to wood splitting in an open-pollinated Eucalyptus grandis population. Although the power to detect molecular markers in this population is low, the resultant markers are likely to be more robust and be transferred to non-related populations. Bulked segregant analysis was used in the identification of markers from high and low splitting individuals that were selected by means of backward selection using Best Linear Prediction. The bulks were screened for differences using amplified fragment length polymorphic and random amplified polymorphic DNA primers. Following regression analysis one putative sequence characterized amplified region has been linked to splitting.

Résumé
Identification de marqueurs PCR liés au défaut de fente du bois chez Eucalyptus grandis . La fente du bois est un défaut chez l'eucalyptus qui entraîne des pertes considérables lors de la transformation du bois en produits finis massifs. Classiquement chez les arbres forestiers, les marqueurs moléculaires sont identifiés en étudiant les descendants d'un seul croisement. Ceci limite l'application de ces marqueurs à cette seule population. Dans cette étude, nous avons cherché à identifier des marqueurs moléculaires liés vraisemblalement au défaut de fente du bois dans une population d'Eucalyptus grandis issue de pollinisation libre. Bien que le pouvoir de détection de marqueurs moléculaires dans cette population soit faible, il est probable que les marqueurs résultants soient plus robustes et transférables à des populations non apparentées. Une analyse de ségrégation en mélange (BSA) a été utilisée pour l'identification de marqueurs à partir d'individus contrastés pour le défaut de fente et choisis par sélection à rebours à l'aide de la BLP (Best Linear Prediction). Les deux lots ainsi constitués ont été examinés pour leur différence à l'aide de marqueurs ADN (AFLP et RAPD). À la suite d'une étude de régression, nous avons pu relier une SCAR putative au défaut de fente du bois.

Key words: wood splitting / molecular markers / Eucalyptus grandis / BLP

Mots clés : défaut de fente du bois / marqueurs moléculaires / Eucalyptus grandis / BLP

Correspondence and reprints: Eugenia Barros Tel.: +2712 841 3221; fax: +2712 841 3651; ebarros@csir.co.za

© INRA, EDP Sciences 2002