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Ann. For. Sci.
Volume 65, Number 7, October-November 2008
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Article Number | 710 | |
Number of page(s) | 13 | |
DOI | https://doi.org/10.1051/forest:2008057 | |
Published online | 24 October 2008 |
DOI: 10.1051/forest:2008057
Genetic structure of Tunisian natural carob tree (Ceratonia siliqua L.) populations inferred from RAPD markers
Makrem Afif1, Chokri Messaoud1, Abdennacer Boulila1, Hnia Chograni1, Afef Bejaoui1, Mohamed Nejib Rejeb2 and Mohamed Boussaid11 National Institute of Applied Sciences and Technology (INSAT) Department of Biology Laboratory of Plant Biotechnology Centre Urbain Nord, BP 676, 1080 Tunis Cedex, Tunisia
2 National Institute of Research in Agricultural Engineering, Water and Forests, BP 10, Ariana- 2080 Tunisia
Received 29 October 2007; accepted 1 July 2008; published online 24 October 2008
Abstract - Seven RAPD markers were used to assess the genetic diversity and structure
of ten Tunisian natural Ceratonia siliqua L. populations from different geographic and
bioclimatic zones.
The species maintain a high diversity within population as estimated by
the percentage of polymorphic loci and Shannon's index (P% = 76.31,
= 0.569). The range of variation
between populations was large. Populations from the upper semi-arid
bioclimates, with more continuous distribution area showed the highest level
of variation.
A high genetic differentiation among populations (
= 0.250
and
= 0.347), as a result of
population isolation was revealed. Nevertheless, the genetic structure is in
accordance with bioclimate indicating that ecological factors also should
influence differentiation. Populations from the sub-humid, upper semi-arid
and mean semi-arid zones clustered together and were distinct from those of
the lower semi-arid ones.
Conservation strategy should be made according to the level of
polymorphism within population and bioclimate.
Résumé - Structure génétique des populations
naturelles du caroubier (Ceratonia siliqua L.) en Tunisie estimée par les marqueurs RAPD. Sept marqueurs RAPD ont été utilisés pour analyser la
diversité et la structure génétique de dix populations
tunisiennes de caroubier (Ceratonia siliqua L.) prospectées dans différentes zones
géographiques et bioclimatiques.
L'espèce maintient une diversité génétique intra
population importante (
= 76.31;
= 0.569) et les niveaux de variation diffèrent
selon les populations. Celles du subhumide et du semi-aride supérieur,
à aire de distribution plus continue, ont montré la variation la
plus importante.
Une forte différenciation (
= 0.250 et
= 0.347) entre les populations, due
à leur fragmentation récente, est observée. Toutefois, cette
différenciation concorde avec le bioclimat des sites témoignant
l'influence des facteurs écologiques dans cette différenciation. Les
populations du subhumide, du semi-aride supérieur et du semi-aride moyen
constituent un groupe distinct de celui représenté par les
populations du semi-aride inférieur.
La conservation des populations doit tenir compte de leur niveau de
diversité génétique intra population et du bioclimat.
Key words: genetic diversity / RAPD / Ceratonia siliqua / natural populations / bioclimate / conservation
Mots clés : diversité génétique / RAPD / Ceratonia siliqua / populations naturelles / bioclimat / conservation
Corresponding author: mohamed.boussaid@insat.rnu.tn
© INRA, EDP Sciences 2008