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Ann. For. Sci.
Volume 65, Number 8, December 2008
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Article Number | 805 | |
Number of page(s) | 10 | |
DOI | https://doi.org/10.1051/forest:2008069 | |
Published online | 04 December 2008 |
DOI: 10.1051/forest:2008069
Molecular characterization and genetic relationships among most common identified morphotypes of critically endangered rare Moroccan species Argania spinosa (Sapotaceae) using RAPD and SSR markers
Khalid Majourhat1, 2, Youssef Jabbar1, Abdellatif Hafidi1 and Pedro Martínez-Gómez21 Faculté des Sciences Semlalia, University Cadi-Ayyad of Marrakech, Morocco
2 Department of Plant Breeding, CEBAS-CSIC, PO Box 164 30100 Espinardo (Murcia), Spain
Received 16 June 2008; accepted 8 September 2009; published online 4 December 2008
Abstract - The objective of this work is the molecular characterization of most common
identified morphotypes of critically endangered rare Moroccan species
Argania spinosa.
Eighteen RAPD markers and twenty SSR markers have been assayed in 38 argan
tree accessions from the three most commonly identified morphotypes: oval,
spherical and spindle fruit types.
A total of 140 polymorphic RAPD bands were detected out of 146 bands. The
number of presumed alleles revealed by the SSR analysis ranged from 1 to 5
alleles per locus with a total number of 32 alleles identified. Results
demonstrated an extensive genetic variability within the tested argan
accessions. RAPDs presented a high level of polymorphism and greater
information content than SSRs.
Our results could indicate that Vitellaria paradoxa is genetically closer to argan than
Manilkara huberi. In addition, the correlation between the clustering based on RAPD and SSR
markers were in general low. The observed clustering could be better
explained according to geographic proximity than morphotype. For this reason
the traditional morphological characterization of the argan accessions in
morphotypes (according to fruit phenotype) seem not to be in correlation to
the real genetic background (genotype) of this specie. The implications of
these results in the creation of effective germplasm core collection in
argan have been also discussed.
Résumé - Caractérisation moléculaire et relation
génétique entre les morphotypes les plus connus d'une espèce
marocaine rare et menacée, Argania spinosa (Sapotaceae) à l'aide de marqueurs RAPD et SSR. L'objectif de ce travail consiste en la caractérisation moléculaire
et l'étude des relations génétiques entre des morphotypes
identifiés chez une espèce marocaine rare et menacée, l'arganier
(Argania spinosa).
Pour cela, dix-neuf marqueurs RAPD et vingt marqueurs SSR on été
testés dans 38 accessions d'arganier des trois morphotypes du fruit
identifiés: ovale, sphérique et broche.
En utilisant la technique d'amplification au hasard de l'ADN (RAPD), 140
fragments polymorphes ont été détectés parmi les 146
amplifiés. Le nombre d'allèle révélé par l'analyse des
marqueurs microsatelittes (SSRs) varie de un à cinq allèles par
locus avec un total de 32 allèles identifiés. Les résultats
démontrent une grande variabilité génétique au sein des
accessions d'arganier testées. Les marqueurs RAPD présentent un taux
de polymorphisme et une hétérozygotie attendue supérieurs aux
SSR.
Les résultats indiquent également que Vitellaria paradoxa est plus proche
génétiquement de l'arganier que Manilkara huberi. La corrélation entre les
groupements observés dépend plus de la proximité
géographique que de la classification selon la forme du fruit
(morphotypes). La classification traditionnelle par morphotypes n'est donc
pas en accord avec l'analyse génotypique chez cette espèce. L'apport
de ces résultats pour la création d'une collection de
référence chez cette espèce est discuté.
Key words: argan tree / Argania / core collection / genetic relationships / RAPD / Sapotaceae / SSR / taxonomy / transferability
Mots clés : arganier / Argania / collection noyau / relations genetiques / RAPD / Sapotaceae / SSR / taxonomie / transférabilité
Corresponding author: pmartinez@cebas.csic.es
© INRA, EDP Sciences 2008