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Ann. For. Sci.
Volume 66, Number 7, October-November 2009
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Article Number | 703 | |
Number of page(s) | 10 | |
DOI | https://doi.org/10.1051/forest/2009053 | |
Published online | 02 October 2009 |
Number of pages: 10
DOI: 10.1051/forest/2009053
Genetic similarity of natural populations and plantations of Pinus roxburghii Sarg. in Nepal
Archana Gauli1, Oliver Gailing1, 2, Valdir Marcos Stefenon1, 3 and Reiner Finkeldey11 Forest Genetics and Forest Tree Breeding, Büsgen-Institute, Georg-August University, Göttingen Büsgenweg 2, 37079 Göttingen, Germany
2 School of Forest Resources and Environmental Science, Michigan Technological University, USA
3 Federal University of the Pampa, São Gabriel, RS, Brazil
Received 30 November 2008; Accepted 5 April 2009 ; Published online 2 October 2009
Abstract
• Genetic structures of five population pairs each consisting of one natural population and one neighbouring plantation of Pinus roxburghii Sarg. in Nepal were assessed using nuclear (nSSRs) and chloroplast microsatellite loci (cpSSRs).
• The mean number of alleles at nSSRs loci in natural populations was 5.0 compared to 4.93 in plantations while the average observed heterozygosities were the same in both groups (
H0=0.50). Most of the alleles were common to all the populations, indicating that the populations correspond to a single genetic entity. Similarly forty-seven haplotypes were observed in natural populations compared to fifty haplotypes in plantations. Mean haplotype diversities of natural populations (0.953) and plantations (0.955) were very similar. Genetic diversity of Pinus roxburghii was relatively high with low or no evidence of inbreeding while genetic differentiation among all populations was very low (about 1%).
• The very low differentiation among natural populations indicates efficient long- distance gene flow among populations resulting in homogeneous genetic structures at least at selectively neutral loci. Even though the harvest and production of seeds and seedlings was largely uncontrolled, genetic structures of most plantations show no signs of reduced variation, inbreeding or other negative effects compromising the adaptedness or adaptability of planted forests.
Résumé - Similitude génétique des populations naturelles et des plantations de Pinus roxburghii Sarg. au Népal.
• Les structures génétique de cinq paires de populations composées
chacune d'une population naturelle et d'une plantation voisine de Pinus
roxburghii Sarg. au Népal ont été évalués à l'aide de loci
nucléaires (nSSRs) et de loci microsatellites chloroplastiques (cpSSRs).
• Le nombre moyen d'allèles à loci nSSRs dans les populations
naturelles était de 5,0 comparé à 4,93 dans les plantations
alors que la moyenne des hétérozygoties observées étaient
les mêmes dans les deux groupes (
H0=0,50). La plupart des
allèles étaient communs à toutes les populations, indiquant que
les populations correspondent à une seule entité génétique.
De même, quarante-sept haplotypes ont été observés dans les
populations naturelles par rapport à cinquante haplotypes dans les
plantations. La diversité moyenne des haplotypes des populations
naturelles (0,953) et des plantations (0,955) étaient très
similaires. La diversité génétique de Pinus roxburghii a été
relativement importante, avec peu ou pas de preuve de consanguinité
tandis que la différenciation génétique entre les populations
était très faible (environ 1 %).
• Le très faible différenciation entre les populations naturelles
indique des flux de gènes efficaces à longue distance entre les
populations issues de structures génétiques homogènes avec au
moins une sélectivité neutre des loci. Même si la récolte et
la production de semences et de plants ont été largement
incontrôlées, les structures génétiques de la plupart des
plantations ne montrent aucun signe de réduction de la variation de la
consanguinité ou d'autres effets négatifs compromettant la
faculté d'adaptation des forêts plantées.
Key words: genetic diversity / genetic differentiation / forest reproductive material / nuclear microsatellites / chloroplast microsatellites
Mots clés : diversité génétique / différenciation génétique / matériels forestiers reproducteurs / microsatellites nucléaires / microsatellites chloroplastiques
Corresponding author: rfinkel@gwdg.de
© INRA, EDP Sciences 2009