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Ann. For. Sci.
Volume 59, Number 5-6, July-October 2002
Proceedings of the Wood, Breeding, Biotechnology and Industrial Expectations Conference
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Page(s) | 699 - 708 | |
DOI | https://doi.org/10.1051/forest:2002058 |
DOI: 10.1051/forest:2002058
What can nuclear microsatellites tell us about maritime pine genetic resources conservation and provenance certification strategies?
Jérémy Derorya, Stéphanie Mariettea, b, Santiago C. Gonzaléz-Martínezc, David Chagnéa, Delphine Maduraa, Sophie Gerbera, Jean Bracha, François Persynd, Maria M. Ribeiroe and Christophe Plomionaa INRA, Équipe de Génétique et Amélioration des Arbres Forestiers, 69 route d'Arcachon, 33612 Cestas Cedex, France
b Cemagref, Domaine des Barres, 45290 Nogent-sur-Vernisson, France
c CIFOR-INIA, Department of Breeding and Biotechnology, P.O. Box 8111, 28080 Madrid, Spain
d Services Espaces Verts, 62520 Le Touquet, France
e Escola Superior Agrária, Dep de Silvicultura e Recursos Naturais, Quinta da Senhora de Mércules, Apdo 119, 6001-909 Castelo Branco, Portugal
(Received 16 August 2001; accepted 13 March 2002)
Abstract
Maritime pine (Pinus pinaster Ait.) is the first conifer used for reforestation in
France and now covers 2.4 million ha of the Iberian Peninsula. In order to preserve the
genetic resources of this economically and ecologically important species prior knowledge of
the distribution of genetic diversity is needed. In this paper, a genetic diversity study was
performed using nuclear simple sequence repeats (SSRs or microsatellites). Classical
parameters of diversity (allelic richness and heterozygosity) and differentiation were
estimated for 47 populations of P. pinaster. Most of the populations (40) were
collected in France, six populations were also collected in the Iberian Peninsula and one
Moroccan population was also included in the study. The population genetic parameters
indicated that some populations should be a focus of conservation efforts (higher level of
diversity, higher allelic richness and presence of rare alleles). A diagnostic test for
sample origin was developed to distinguish Corsican from Landes populations.
Résumé
Que nous indiquent les microsatellites nucléaires sur la conservation des ressources
génétiques du pin maritime et sur les stratégies de certification de provenances ?
Le pin
maritime (Pinus pinaster Ait.) est le premier conifère utilisé pour le reboisement en
France et couvre environ 2,4 millions d'hectares dans la péninsule Ibérique. Dans le but de
conserver les ressources génétiques de cette espèce, importante du point de vue économique et
écologique, une connaissance préalable de la distribution de sa diversité génétique est
nécessaire. Dans ce papier, une étude de diversité génétique a été menée en utilisant des
marqueurs microsatellites. Les paramètres classiques de diversité (richesse allélique et
hétérozygotie) et de différenciation ont été calculés au sein de 47 populations. La plupart
des populations (40) ont été échantillonnées en France, six populations ont été choisies dans
la Péninsule Ibérique et une population marocaine a également été incluse dans l'analyse. Les
résultats de génétique des populations montrent que certaines populations pourraient être
intéressantes pour la conservation des ressources génétiques de l'espèce (niveau
d'hétérozygotie ou de richesse allélique plus élevée que les autres populations, présence
d'allèles rares). Nous avons montré que les résultats de cette analyse fournissent un test
diagnostic pour distinguer les populations d'origine landaise des populations d'origine
corse.
Key words: Pinus pinaster / nuclear microsatellites / genetic diversity / conservation / provenance identification
Mots clés : Pinus pinaster / microsatellites nucléaires / diversité génétique / conservation / certification de provenance
Correspondence and reprints: Christophe Plomion Tel.: +33 5 57 12 28 38; fax: +33 5 57 12 28 81; plomion@pierroton.inra.fr
© INRA, EDP Sciences 2002