Ann. For. Sci. 66 (2009) 508
Number of pages: 12
DOI: 10.1051/forest/2009033

X-ray tomography as a tool for detailed anatomical analysis

Jan Van den Bulcke¹, Matthieu Boone², Joris Van Acker¹, Marc Stevens¹ and Luc Van Hoorebeke<sup>2

1</sup>  Laboratory of Wood Technology, Faculty of Bioscience Engineering, Ghent University, Coupure Links 653, 9000 Ghent, Belgium
²  Department for Subatomic and Radiation Physics, Faculty of Sciences, Ghent University, Proeftuinstraat 86, 9000 Gent, Belgium

Received 21 August 2008; Accepted 11 February 2009; Published online 9 July 2009

Abstract
• Wood identification, anatomical examination and retrieval of quantitative information are important aspects of many research disciplines. Conventional light microscopy with a camera and (semi)-automatic image analysis software is an often used methodology for these purposes. More advanced techniques such as fluorescence, scanning electron, transmission electron, confocal laser scanning and atomic force microscopy are also part of the toolset answering to the need for detailed imaging.
• Fast, non-destructive visualization in three dimensions with high resolution combined with a broad field of view is sought-after, especially in combination with flexible software.
• A highly advanced supplement to the existing techniques, namely X-ray sub-micron tomography, meets these requirements. It enables the researcher to visualize the material with a voxel size approaching < 1 m for small samples (< 1 mm). Furthermore, with tailor-made processing software quantitative data about the wood in two and three dimensions can be obtained. Examples of visualization and analysis of four wood species are given in this paper, focusing on the opportunities of tomography at micron and sub-micron resolution.
• X-ray computed tomography offers many possibilities for material research in general and wood science in specific, as a qualitative as well as a quantitative technique.

Résumé - La micro-tomographie RX, un outil pour une analyse anatomique fine du bois.
• L'identification du bois, l'observation anatomique et l'obtention d'informations quantitatives sont des aspects importants dans différentes disciplines scientifiques. La microscopie optique conventionnelle couplée à l'acquisition et au traitement semi automatique des images est souvent utilisée pour atteindre ces objectifs. Des techniques plus récentes comme la fluorescence, la microscopie électronique par balayage ou par transmission, la microscopie confocale ou encore à force atomique constituent une panoplie d'outils répondant à ces besoins d'imagerie fine.
• Il y a une forte demande d'outils non destructifs de visualisation 3D à haute résolution combinés à un large champ de vision et surtout avec des logiciels flexibles.
• En complément avancé à ces techniques la tomographie RX submicrométrique remplit ces conditions. Elle permet au chercheur de visualiser le matériau avec une taille de voxel inférieure au micron pour de petits échantillons dont la taille est inférieure au mm. En outre, à l'aide de logiciels de traitement adaptés, des données quantitatives peuvent être obtenues pour le bois en deux et trois dimensions. Dans ce papier on présente des exemples de visualisation et d'analyse pour quatre essences en focalisant sur les possibilités de tomographie aux échelles micrométrique et submicrométrique.
• La tomographie RX offre de nombreuses possibilités pour la recherche en science des matériaux en général et en sciences du bois en particulier, que ce soit pour les approches qualitatives ou pour les approches quantitatives.

Key words: X-ray CT / wood / anatomy / image processing

Mots clés : RX CT / bois / anatomie / traitement d'images

Corresponding author: Jan.VandenBulcke@UGent.be

© INRA, EDP Sciences 2009