Issue |
Ann. For. Sci.
Volume 59, Number 2, March 2002
|
|
---|---|---|
Page(s) | 197 - 204 | |
DOI | https://doi.org/10.1051/forest:2002006 |
Ann. For. Sci. 59 (2002) 197-204
DOI: 10.1051/forest:2002006
Dominance of the mycorrhizal fungus Rhizopogon rubescens in a plantation of Pinus pinea seedlings inoculated with Suillus collinitus
Khalid El Karkouria, Francis Martinb and Daniel Mousainaa Laboratoire de Recherches sur les Symbiotes des Racines, Institut National de la Recherche Agronomique, AgroM-INRA, 2 Place Viala, 34060 Montpellier Cedex 1, France
b Unité Mixte de Recherche INRA-UHP Interactions Arbres / Micro-organismes, Centre INRA de Nancy, 54280 Champenoux, France
(Received 15 January 2001; accepted 28 June 2001)
Abstract
We examined the below-ground mycorrhizal diversity of P. pinea seedlings
inoculated with S. collinitus six years after outplanting in a disturbed site,
located at La Petite-Camargue (Gard, France). This was performed using the
polymerase chain reaction (PCR), the restriction fragment length polymorphism
(RFLP) and the sequencing of the nuclear ribosomal internal transcribed spacer
(ITS). Seven and one plants corresponding, respectively, to inoculated and
non-inoculated (control) treatments were chosen randomly. Examinations were
carried out directly from ectomycorrhizae. A total number of 233 root tips
was examined. Five ITS RFLP taxa were detected. The ITS taxon I corresponded
to the ectomycorrhizal species Rhizopogon rubescens. This fungus was abundant
(55%) in the P. pinea ectomycorrhizal community. The other ITS taxa were rare
and remained unidentified. The current P. pinea plantation showed a restricted
diversity of the ectomycorrhizal community which is typical of ectomycorrhizal
communities in young plantations established in disturbed stands.
Résumé
Dominance de l'espèce mycorhizienne R. rubescens dans une plantation
à Pinus pinea.
La diversité ectomycorhizienne de plants de P. pinea,
inoculés par S. collinitus, a été examinée six années après transplantation
dans un site perturbé de La Petite-Camargue (Gard, France). L'identification
de cette diversité fongique a été effectuée à partir de l'espaceur interne
transcrit (ITS) de l'acide désoxyribonucléique (ADN) nucléaire et ribosomal.
Deux marqueurs moléculaires dérivés de la réaction de polymérase en chaîne
(PCR) ont été utilisés : le polymorphisme de fragments de restriction (RFLP)
et le séquençage des produits d'amplification de l'ADN. Sept et un plants
correspondant, respectivement, aux plants inoculés et non inoculés (témoin)
ont été choisis au hasard. Le typage moléculaire a été réalisé directement
à partir des ectomycorhizes. Deux cent trente trois racines courtes mycorhizées
ou non ont été examinées. Cinq types d'ITS RFLP ont été détectés. Le type I
correspond à l'espèce ectomycorhizienne Rhizopogon rubescens. Cette dernière,
est dominante (55 %) dans la communauté ectomycorhizienne de cette plantation.
Les autres types d'ITS RFLP ont été rares et restent non identifiés. La plantation
de P. pinea a montré une faible diversité ectomycorhizienne qui est typique des
communautés ectomycorhiziennes des jeunes plantations établies dans des sites perturbés.
Key words: Pinus pinea L. / plantation / ectomycorrhizal diversity / PCR-RFLP / rDNA (ITS)
Mots clés : Pinus pinea L. / plantation / diversité ectomycorhizienne / PCR-RFLP / ADNr (ITS)
Correspondence and reprints: Daniel Mousain Tel. 04 99 61 24 53; Fax. 04 67 54 57 08;
e-mail: mousain@ensam.inra.fr
© INRA, EDP Sciences 2002