Ann. For. Sci. 65 (2008) 107
DOI: 10.1051/forest:2007079

SSR-based tool for identification and certification of commercial Populus clones in Spain

Ana I. de-Lucas, José C. Santana, Patricia Recio and Elena Hidalgo

Departamento de Producción Vegetal y Recursos Forestales, E.T.S., Ingenierías Agrarias, Universidad de Valladolid, Avenida de Madrid 44, 34004 Palencia, Spain

(Received 6 November 2006; accepted 3 October 2007; published online 18 December 2007)

Abstract - In order to protect the legitimate interests of the poplar breeders, growers and industries, we have developed a reliable and affordable certification tool for commercial poplars in Spain. We have carried out a genetic description of the 28 commercial clones of the current Spanish National Catalogue using 10 microsatellite molecular markers (SSR). The results clearly show that in the Spanish National Catalogue there are labelling mistakes including synonymies, supported by a combined probability of identity (PI) of 1.18 10^-9. We have also demonstrate that it is possible to identify all the different clones (genotypes) with only three microsatellites, that show a combined probability of identity of 2.4 10^-4, and we have optimised the protocols to reduce the time and the economical costs of the analysis. This SSR-based tool could be incorporated in the current certification protocols, to avoid duplication of accessions and identification mistakes.

Résumé - Développement de marqueurs microsatellites pour l'identification et la certification des clones commerciaux de peuplier en Espagne. Dans le but de protéger les intérêts légitimes des cultivateurs, des sélectionneurs et des industriels de la populiculture, nous avons mis au point un outil de certification fiable et accessible pour les clones de peupliers commerciaux en Espagne. Nous avons fait une description génétique des 28 clones commerciaux de l'actuel catalogue national espagnol en utilisant 10 marqueurs moléculaires microsatellites (SSR). Les résultats obtenus indiquent clairement que ce catalogue contient des erreurs d'identification, dont des clones synonymes, soutenues par une probabilité combinée d'identité (PI) de 1.18 10^-9. Nous avons également démontré qu'il est possible d'identifier tous les génotypes différents avec 3 microsatellites, qui montrent une probabilité combinée d'identité de 2.4 10^-4, et nous avons optimisé les protocoles afin de réduire le temps et le coût de l'analyse. Cet outil fondé sur les SSR pourrait être intégré dans les protocoles actuels de certification afin d'éviter la duplication des matériaux et les erreurs d'identification.

Key words: commercial poplar clone / microsatellite / identification / Spanish national catalogue

Mots clés : clone commercial de peuplier / microsatellite / identification / catalogue national espagnol

Corresponding author: ailucas@pvs.uva.es

© INRA, EDP Sciences 2007