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Ann. For. Sci.
Volume 65, Number 1, January-February 2008
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Article Number | 107 | |
Number of page(s) | 7 | |
DOI | https://doi.org/10.1051/forest:2007079 | |
Published online | 18 December 2007 |
DOI: 10.1051/forest:2007079
SSR-based tool for identification and certification of commercial Populus clones in Spain
Ana I. de-Lucas, José C. Santana, Patricia Recio and Elena HidalgoDepartamento de Producción Vegetal y Recursos Forestales, E.T.S., Ingenierías Agrarias, Universidad de Valladolid, Avenida de Madrid 44, 34004 Palencia, Spain
(Received 6 November 2006; accepted 3 October 2007; published online 18 December 2007)
Abstract - In order to protect the legitimate interests of the poplar breeders, growers
and industries, we have developed a reliable and affordable certification
tool for commercial poplars in Spain. We have carried out a genetic
description of the 28 commercial clones of the current Spanish National
Catalogue using 10 microsatellite molecular markers (SSR). The results
clearly show that in the Spanish National Catalogue there are labelling
mistakes including synonymies, supported by a combined probability of
identity (PI) of 1.18 10-9. We have also demonstrate that it is
possible to identify all the different clones (genotypes) with only three
microsatellites, that show a combined probability of identity of 2.4
10-4, and we have optimised the protocols to reduce the time and the
economical costs of the analysis. This SSR-based tool could be incorporated
in the current certification protocols, to avoid duplication of accessions
and identification mistakes.
Résumé - Développement de marqueurs microsatellites pour l'identification et la
certification des clones commerciaux de peuplier en Espagne. Dans le but de protéger les intérêts légitimes des
cultivateurs, des sélectionneurs et des industriels de la populiculture,
nous avons mis au point un outil de certification fiable et accessible pour
les clones de peupliers commerciaux en Espagne. Nous avons fait une
description génétique des 28 clones commerciaux de l'actuel
catalogue national espagnol en utilisant 10 marqueurs moléculaires
microsatellites (SSR). Les résultats obtenus indiquent clairement que ce
catalogue contient des erreurs d'identification, dont des clones synonymes,
soutenues par une probabilité combinée d'identité (PI) de 1.18 10-9. Nous avons également démontré qu'il est possible d'identifier
tous les génotypes différents avec 3 microsatellites, qui montrent
une probabilité combinée d'identité de 2.4
10-4, et nous
avons optimisé les protocoles afin de réduire le temps et le
coût de l'analyse. Cet outil fondé sur les SSR pourrait être
intégré dans les protocoles actuels de certification afin
d'éviter la duplication des matériaux et les erreurs
d'identification.
Key words: commercial poplar clone / microsatellite / identification / Spanish national catalogue
Mots clés : clone commercial de peuplier / microsatellite / identification / catalogue national espagnol
Corresponding author: ailucas@pvs.uva.es
© INRA, EDP Sciences 2007